Strain
Bat_MK720944
(Region: China; Strain: Tylonycteris bat coronavirus HKU33 strain GZ151867, complete genome.; Date: 9-Sep-15)
Gene
orf1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
orf1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGTCTAGCAACCCTATTTCAGTGGCAATAGCTGCTGATGTTGAAATTTCATGTTTGGGTTTCCTTGATGTTAGTCAAGCCGTCTCATTTTATAGTGATGCCGCTTCTAACGATTTTAAGGGATGCCGCTTTGTTCCAATTTCTGACCGTGATAATATCGAAGCTATGCTTGAAGATGATTTCGTCTGCATGGTAATTGGTAATGATCACCGTCTTGTTATTGGTGAGTTTAAAAGCCGTCCTGTCGGTTTAAAAGGTTGGCTTTTATTCTCTACATGTCCAATTAACGGCTTTACCTTTGTGACCTTAAATGGTTTTGCAGGTGGAGTTGTTAATGTGGATAATTACCTTTGTGATTCTTATGGCAAGCCAGTGTTATCGTCAGATATTTGGCAATGTCAAGATTACTTTGGTGAATTAGACACTGTTGTTGTCAATGGTGTCTCTTACTTTAAGGCTTGGAGCGTTGAACGCGATGATTTGTCTTATAATCTTCAATCTGTGACTGCTATAAAATCTATAGTTTGGAATTGTGATGCTGCCCATGTACTCCCTGATGGAACTGTGCGTAGTGTTGCAAAGCCTGTGACTAAGAGTAAAGTTGTTAAGCTCTCTGAGCCTTTTGCAACTGTTTATGAACAGATTGGTAGTCCATACATGACCAATGGTGTTTTACTTTTGGATGTCTTGACTAAGCCTTGTTTCTTACATGCCTATGTTCATTGTAAGTGTGGTAATAAACGATGGACTGTTGGCGATTGGCATGTTGGTTACAAATCACCTTGTTGTGGTTTGAAATGCACGCCAATTTGCTATGCTACTGGCTATGTTGAACCAGGTGACGTTGTTCTCACCTCTGTAAGTGCTGGTTCTGGTACTAAGTACTATAAAGGTTGTACTTTAAAGTACGTTGGTGATGCTTCTAAAGTTTCCATTTGGCGTGTGTTGAAAACTCATGCCGTGGATGGATTTGTGTCATGCAGTCGTTTTGAAGATGAATTTGTAGCATCTTTTGATTCTTGTAGTGTTGAGAACACTTCTTCATTAGCATTGTCGCTAAAGTATGGTTTACTTAGTGGTGATTATGATGATAGTGTTGTTAATGCTGTCAAGAGTGGAGTTATTAACTTGGGGTTGTCCATAGTTGATGTTTTTGATGATATTTGTGTTATTCCAAAATGGCTTCAAAAGTTAGGTACTTTGGGTTTAAACATCTGGTCTAGCTTTAAAACTTTTTTGCATACAGTTTTTGAAACTTCTGAGAAACTAGTTGGTTTTATCAATTTTATTTCTAATGCTACTTGTGTTGTGGCTAATGGTATTTTAGACTTGGTTATTCCTGTGAGTTCTTCTTGGAATGTTATAGTGGACCATCTTAAAAATTTGGTTCAGGGAGCTGTTACACTTTTTGTGGATGAGTTCAAGTTTGCTGGTGCAAGTTTTAAGCGTTTTGCTGATTATGTGCTTTTTGACAATGCTCTCTGCCATTTGGCTAGTGCGAGAATTAAAGGTACTAAGCAGGATGGTCTTAAAAATGCTAATTATTTGAGCATTGTTTATGGTCCTACTAAGCGTGTTAAAGTGTCACGTTTTGAAAAGTCAACTGCCAATTTGTCCATTTGTGAAGATAACATTCCTCCAGAGCAAGGCAATGCCGTTGTTATTGGTGATATTGCTTTCTTTACAGATGGTACATATTATTGGTTTATGGCTGATAATGCATCTGTATTGGAAACACCAGTCTTTAAGACTGGTAGTTTTCAGTGTCCTGATTTATTGGAACAAGTTGATAGTGGTACAATCTTTCAAAAGGTTGTTTCATCTATTAATGATTCTTCTGGTTTTTGTAAAAACCTTAAAGTTGATTATGGCCTTGAGGGTTTTGTTGTTAATGCCCCTAAGAAGTATAAATCATTTGCTAATAGTGTTTCTACTATGTATAATGATTTTGCTACAAGTGTTTCTAGTGTTGTTAAACTGGCTGGTGTTAGTTTTACACATTATGCATTCATAAAACCTATGTTGGCCTTTAATGGTACATTGTTTCTAGTAGACAAAAAGGTTGCACCATCTAACGTTCCTGTTGTAGATTCTCTTAAGGACTTTATGGTCTTTAAGGATGTTAAAACAAAAGTTGTACCTAAGGGAATTGATGTTGAAGAATGTGAACTTCTTGAGGCTCCTTTTAAGAAGCCTGTTGATGGAGGTGTCATTAAAGTAATAGATGGTTATGCTTTCTATTGTGTTAATGATTTTTATTACCCAGCTTCATGTGATGGTGTTGTCAATATGACATTTACAAAGAAGTGTGGTGGTTCTGTCTCTTTTTCTGATGAAGAAATTGTTTATGAGATAGATCCTGTGCACAAAGTTTATGTGACTTTTGAGTTTGAAGATGATATAATCTCTGCTGTACTTGATAAAGTTGTAGGTTACAAATTAACATTTGAGGGTGATTCTTGGGATGAATTTTTAACAGCAGTCAATAATGTTATGAATGCTGTTTCGTCGCAAATTGAATTGCCTGAATATTATGTTTATGATGAGGAAGGTGGTAATGACTATACTAAGCCTGTCATGATTTCACAGTGGCCTTTGACTGATACAGTTAATTCTGTAGTTGATGAAACACTTGATGAACAGGTTGAAGAAACTGAAGTAATCCCTGTTGTGGAAGATGCTGTTAATTCGGAAATTGAAGAAGTTAATGCAGCATTTGGTCCTGTTGAAGATGTAAAACCACTAGTTAAAAGTCCTTTTGCTTTTGATTATTACAAGAGTGGTGACTTAGTGGTTTTAAAACAGGATAGTAACAACTGTTGGGTTAACTCAGCTTGTATACACCTTCAAATATTAGACTTTGAAGACCCTGCCTTGGACTTATTTAAGGTTGGTAGGGTCGCTCCACTTGTGCAGCGTTGTTATGAAGCTGTTAATTTGGTTAAGGGTTCTATGGGTGATGTTACAGAGTGTCTTGAGTTTTTGCTTAAAGATTTTAAATCTTGTACAATTAAATTTGATGCTACTTGTAACTGTGGTCCTTCAGAGTATGTTTTGAATGGCTGCGTGTTTCGTTTTATGCCCAATTCTGAACCTTTACATCAGTATTGTAATGTTTGTAACAGTGTTTTGTTTTGTAACATAAAGAGTATTAAAGGCAGTGCTGTTTTCTGTCAAAATCCTGGTCCTGTTGATGACATGTTTGTAAAGCCAGATGTAGCCGCATCTTTTATTGGTAGCATTAGTGGCGGTCATTACTGTACTAATGTTTACGCAATGAATGTAGCACTTGATGGTTTTGGTACACATACTATAGACAATGATTCTCTGCACACATTTTGTGTTAAAGATGTTGACTGGGTGAAACCAGAGACAGTGAAACCTTTTTGTACTTATAGGAATGTTAGTTTTTATAAAGGTGATTTTAAAGACCTTGTTGATATACCTCATGATTTTGTTGTTAATGCAGCAAATGAAAACCTTCAGCATGGAGGTGGTGTAGCCAAAGCCATAGACGTCTACACCAATGGTACTTTGCAGAGAGAATCTGTTAAGTATGTTAAAGCTAATGGCCAGGTTCGTAAAGGACATGGTGTTATGCTTGATTGTGATGGTATTAATGTCTTTAATGTGGTTGGTCCACGTAAGACAAAGAAGTGTAGCATTTCTTCATGTAAGGACGCTTTGCTTCAAGCATACACAGCTGTTTATAATAACAATGGTGTGCCACTTACTCCACTTCTTAGTGTTGGTATTTTTGGTGTGCCCATTGATATTTCTCTTTCTGTGTTTTTAGATGTTACAGGTGAACGTGTAAGTAATTGTTTCTGTTATACTGATTCAGAAGCGAATGCTATAAAAGAGTTAGTTGATAGTCTTAACACAGTTTACCAAGCTTCTGCAGTTGCATCTTCTGTTAAAATAGAACAAAACCTGAAACCTTATTTGGTTGAAGGTGGTGTTTCTTTTTATAATTGTGAAGCTGTTACAATTAGTGATGAGTTTGATCGCTATGTCTTCTTTATTGAAGAAAGTAAGAAGATGTGTGATTTGGCCTTATCATTTAATGAAATTGTTGGTGGAGCTTGTTCTGATGCATTAACACAATGTGGTAAGTTGCCAGCTGGTAATGTTTTAACAATTAAAGTTAGTGGTGACGATGCAAGAGAATTTTATGTCTCTTTTATAGTGTTGCCAAAAATTGGTGATGTTGGTTATGATAAAAATCTTAACCGTGCAATTAACAAACTTTTTAAGTTTGGTGATAAATATGTTGTCACAGTTCCTAATGTGGAAGTCTTTTCAAAAATTGTGGTTAAGTCTAATGCTTTTTGGGTTTGTTCTAAGACAGAACCCATTGTTAGTAAGTACTTTGAGAAGCGTGACATTCCTGTGGTTATTACAGAGAATTCACGTGATTTTCAGAGGGTTGTACTTGACTCTAAAAAGACTTTTAATGATCAACTTGGTGTTTGTACTGTTAATAACATAGATGTTACAGATAAAGTTGTAACGCCTGTCAAAGAAGTAGTAGCAGTTGCACCAGAAGTTGACTGGGATTCATATTATAAGTTTGATAATGCTAGTGCATTTCAAACATTGGATCACTCTAGTTATGAATTTGAAAATAAAATTGTAAATGGTAGGCGTGTATTAAAGAGCTCAGACAATAATTGTTGGGTTAATGCTACATGTTTGCAATTGCAATTTATGGATGCAAATTTTATTAGCATTGGTTTGAATGCTATGTGGGATGATTACATAGTAGGTAATGTTGGTAAATTTGTTCATTGGCTTTATTTACAAGCTGGTTTAAACAAAAATGATAAGGGTGATTCTGAAAGTTTGTTTTTAAAAATCGCCAAATATTTAAAACCTACTGCTAAGTTTACAGTAGAAAAGTCTACAGACACTGGTTGTTGTGATGAGAGCTATATTGTTAATAGTGCTGTCCTAAGTTCTTGTGTTCTTAGGAGTGGTATTAATGACGGTTTTTGTAA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Protein
MSSNPISVAIAADVEISCLGFLDVSQAVSFYSDAASNDFKGCRFVPISDRDNIEAMLEDDFVCMVIGNDHRLVIGEFKSRPVGLKGWLLFSTCPINGFTFVTLNGFAGGVVNVDNYLCDSYGKPVLSSDIWQCQDYFGELDTVVVNGVSYFKAWSVERDDLSYNLQSVTAIKSIVWNCDAAHVLPDGTVRSVAKPVTKSKVVKLSEPFATVYEQIGSPYMTNGVLLLDVLTKPCFLHAYVHCKCGNKRWTVGDWHVGYKSPCCGLKCTPICYATGYVEPGDVVLTSVSAGSGTKYYKGCTLKYVGDASKVSIWRVLKTHAVDGFVSCSRFEDEFVASFDSCSVENTSSLALSLKYGLLSGDYDDSVVNAVKSGVINLGLSIVDVFDDICVIPKWLQKLGTLGLNIWSSFKTFLHTVFETSEKLVGFINFISNATCVVANGILDLVIPVSSSWNVIVDHLKNLVQGAVTLFVDEFKFAGASFKRFADYVLFDNALCHLASARIKGTKQDGLKNANYLSIVYGPTKRVKVSRFEKSTANLSICEDNIPPEQGNAVVIGDIAFFTDGTYYWFMADNASVLETPVFKTGSFQCPDLLEQVDSGTIFQKVVSSINDSSGFCKNLKVDYGLEGFVVNAPKKYKSFANSVSTMYNDFATSVSSVVKLAGVSFTHYAFIKPMLAFNGTLFLVDKKVAPSNVPVVDSLKDFMVFKDVKTKVVPKGIDVEECELLEAPFKKPVDGGVIKVIDGYAFYCVNDFYYPASCDGVVNMTFTKKCGGSVSFSDEEIVYEIDPVHKVYVTFEFEDDIISAVLDKVVGYKLTFEGDSWDEFLTAVNNVMNAVSSQIELPEYYVYDEEGGNDYTKPVMISQWPLTDTVNSVVDETLDEQVEETEVIPVVEDAVNSEIEEVNAAFGPVEDVKPLVKSPFAFDYYKSGDLVVLKQDSNNCWVNSACIHLQILDFEDPALDLFKVGRVAPLVQRCYEAVNLVKGSMGDVTECLEFLLKDFKSCTIKFDATCNCGPSEYVLNGCVFRFMPNSEPLHQYCNVCNSVLFCNIKSIKGSAVFCQNPGPVDDMFVKPDVAASFIGSISGGHYCTNVYAMNVALDGFGTHTIDNDSLHTFCVKDVDWVKPETVKPFCTYRNVSFYKGDFKDLVDIPHDFVVNAANENLQHGGGVAKAIDVYTNGTLQRESVKYVKANGQVRKGHGVMLDCDGINVFNVVGPRKTKKCSISSCKDALLQAYTAVYNNNGVPLTPLLSVGIFGVPIDISLSVFLDVTGERVSNCFCYTDSEANAIKELVDSLNTVYQASAVASSVKIEQNLKPYLVEGGVSFYNCEAVTISDEFDRYVFFIEESKKMCDLALSFNEIVGGACSDALTQCGKLPAGNVLTIKVSGDDAREFYVSFIVLPKIGDVGYDKNLNRAINKLFKFGDKYVVTVPNVEVFSKIVVKSNAFWVCSKTEPIVSKYFEKRDIPVVITENSRDFQRVVLDSKKTFNDQLGVCTVNNIDVTDKVVTPVKEVVAVAPEVDWDSYYKFDNASAFQTLDHSSYEFENKIVNGRRVLKSSDNNCWVNATCLQLQFMDANFISIGLNAMWDDYIVGNVGKFVHWLYLQAGLNKNDKGDSESLFLKIAKYLKPTAKFTVEKSTDTGCCDESYIVNSAVLSSCVLRSGINDGFCKHGLDCYRRVTSVEGSGIVLNTHEPTVVSKLALLDCVSYTAFSGDIGSGHYVVVDSNTNVSFDGFDVKPTDVSCACVTAVVVKNMYFVSKPNVPSVMPKVVDTLNAAANGFFGCGDFLFKNLFTFLYWLFSMFLLLKNVKKRDISVLALAPERTGIILKRSLRYNLKYSYKYVCSKWSTFKFLSKLFMAIYALYMLLFLLIRFGPLNEPVCSSYVEGYSNSSFVKSDYCDNMFCKLCLYGFQELSDLPHLNLKWEFVTHPLFQSLMPFIYAMFLVCFGNRFVRLFMCYFVLQYVNVLGVLLGVQDSIWALQIIPFDMFCDEIVVCYIVYVVLMFLYHVCFGCEKPNCVACSKSARLTRIPVQTIVNGSTKVVYVTANGGRRAFCKKHNFFCVNCDSYGVGCTFINEHVSRELSNVTKTNVQPTGDAFVVVDKVEFHNGFYYLYSGDVFWRYNFDITESKYGCKEVLKNCNILSDFIVFNNTGSNVTQVHNVCVYLSQLLCKPIKIVDSALLATLDVDFNGSLHAAFVDVLSNSFNKDFSNCPTMADCKNLLGVDVSDEDFYNAVSNAHRFNILLSDLSFNNVVTTYAKPEEKMSTHDMAVCLRTGAKIVNHNVLTKENIPVVWLARDFQSLSEDCRKYVVKTTKQKGVTFFITFNDTRMNLSIPVVSFSCKKGGAKSLSFKWLFVPFLFLFALYLSTSLFIFFENVSSHPGYDFKFIKDGRLYDFNEPLNCVHNVYDNFVPWFESKFGFIPTDGLSCPVVVGVRDDVRTVPGVPSGVVLVGKTLVFALQTVFGEAGNCYDTQGVTHSESCLFTSACTVLSGLAGTATYCFKEGIVEGARLYSALLPNVHYKMEGGQYIKLPDLIVRGAGFRVVRTMATTYCRAGQCVDSKAGVCFGVDRFLVYNAESGSDFVCGSGLFGLLYNLLSIFSSSFSVVALSGQICFNIIVAIIAVFLCFTIVKFKRMFGDMSRGVCIVVATVIVNSLSYVITQNFIGMLIYAAMYFFAIRGLSYSWIWYLGYVVAYSTLAPWWVLVLYVFAGLYGVIPSFLKLKVTAQLFDGDKFVGTFESAAQGTFVLDMHSYEKLVNSVPADKLRQYAASFNRYKYYSGSANEADYRLACFSHLAKAMLDYANNHMDQLYTPPTVSYNSTLQSGLRKMAQPSGLIEKCVVRVSYGNMVLNGLWIGDQVICPRHVIAENTTTVIDYDKAYSLVRLHNFSVVVGNVMLGVVSVAMRGTLLYIKVNQTNVNTPKHTFKVLKPGDSFNILACYEGVASGVYGVTLRNNHTIRGSFINGACGSPGYNLTNGGVEFCYIHQLELGSGCHVGSDINGIMYGGFEDQPTLQVEGASKLFTSNVIAFLYGALLNGCNWWLTSDRVNVDAFNDWACSNDFTTISTVDMYTILSAKTGVDVQRILAAIQRLSKGFGGNKILGYASLTDEFTVGEVVKQMYGVTLQGSKKTRFVGNLFVMCLFIFMFWSEFLSYSTMFWISASVMTPIFLLMCGLSVVLTMFLKHKMLFLNTFLMPSVTLLAFINLSWDWYIREKLSSVFGYHISLMSFDLQGVFNIFICCFASGLHLYRFNSSSIGSVFTLFMSLAATVYNYFYATDYLSVAMVFLLNMSHTWYIGLIVYKLAIFLTPYLSLSLLLAFGSVKVTLLLYVFLGYFSCVYFGFCYWVNRIFKLTLGVYEFKVSAAEFKYMVANGLSAPRGVFDSLWLSFKLMGVGGERTIKVSTVQSKLTDLKCANVVLLGCLSSMNVAANSKDWSYCVDLHNKINLADDPEKAQEMLLALLAFFICKQKDFGVDELLDSYFHDTTLLQSVASTFVSMPSYIAYEKARQEYENSLSNGSTPSVVKQLRRAMNIAKAEFDKEASVQRKINRMAEAAATQMYKEARAVNRKSKVISSLHAMLFSMLRKLDMSSIDNILSLAREGTVPLSIIPTTCATKLNVVCSDLESYSKVVFDSCVQYAGVVWNIIDVRDVDGKVVHLKEITKDNVENISWPIYVNCERMVKLQNNEIMPGKLKQKVLTAEGDGITCNGMALYNNEAGKTFIYAFLADKPDLKIVKCESDSGCVVIELEPPCRFAVETSTGVQVKYLYFVKNLNTLRRGAVLGFIGATVRLQAGKQTELASNCALLTLCSFAVDPAKMYIDSVKSGMKPVGNCVKMLSNGAGNGQAVTVGVEANTNQDSYGGASVCLYCRAHVCHPSMDGQCKYKGRYVQVPLGTLDPIRFCLENKPCTVCGCWIGNGCTCDRSSLQTVDMAYLNRVRGSSGARLEPCNGSSTDHVVRAFDVYNKDVACIGKFLKVNCVRMRNAELSDSFYVVKRCTKSVMEHEQSIYNILKDSGALAPHDFFTWHEGRSVFGNISRQNLTKYTMMDLVFAMRNFDERNCEVFKEILVLTKSCDAEYFNNSKWYDPVENEDIHRVYAKLGRVVSNAMLKCVKLCDFMVESGIVGVITLDNQDLNGDFYDFGDFTKTIPGMGVPCCTSYYSYMMPVMGMTNCLASECFVKSDIFGDDFKTYDLLEYDFTEHKEKLYVKYFKHWGQDYHPNCVDCYDDMCVIHCANFNTLFATTIPETAFGPLCRKVFIDGVPLIATAGYHFKQLGLVWNKDLQLNSYKLSLNELLQVVADPALLVASSPALVDQRTCCFSIAALGTGMTSQTVKPGHFNREFYDFLRSQGFFDEGSELTLKHFFFAQKGDAAVKDFDFYRYNRPTVLDICQAKVTCAVVKRYFDVYEGGCITAKEVVVVNLNKSAGYPFNKLGKAGLYYEALSYEEQDELYAVTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQYHQKHLKSIVNTRNASVVIGTTKFYGGWDNMLRTLIDGVENPHLMGWDYPKCDRALPNMLRMISAMVLGSKHVNCCSASDRYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYFKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQAVSANINRLLSVDSNTCNNLFVKQLQRRLYDSCYRSSSVDEDFVDEFYGYLRKHFSMMILSDDGVVCYNSEYSELGYIADINAFKATLYYQNNVFMSTSKCWVEPDVNKGPHEFCSQHTMQVVDANGTYYLPYPDPSRILSAGVFVDDVVKTDAVVLLERYVSLAIDAYPLSKHSNPEYRKVFYALLDWVKHLNNTLNQGVLESFSVTLLEDQSAKFWSEEFYASMYEKSVILQSAGLCVVCGSQTVLRCGDCLRRPLLCTKCAYDHVIATPHKFVLSVTPYVCNTPDCTVNDVTQLYLGGLSYYCKDHKPQLSFPLCSAGNVFGLYKSSATGSPDVDTFNILACSDWSDVVHYRIANDCRDSIRLFAAETVKAKEECVKSSYASATL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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR009466
NSP11
IPR036499 NSP9_sf
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR014827 Viral_protease
IPR042515 Nsp15_N
IPR002589 Macro_dom
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR014829 NSP8
IPR036333 NSP10_sf
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR037227 EndoU-like
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1159 Identity=59.29%
Cov(Q)=14.05% Cov(P)=96.96%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6591
Number of predicted TMHs:
18
Exp number of AAs in TMHs:
437.319339999996
Exp number, first 60 AAs:
0.04491
Total prob of N-in:
0.04622
outside
1 - 1782
TMhelix
1783 - 1802
inside
1803 - 1847
TMhelix
1848 - 1870
outside
1871 - 1921
TMhelix
1922 - 1944
inside
1945 - 1950
TMhelix
1951 - 1973
outside
1974 - 1987
TMhelix
1988 - 2007
inside
2008 - 2345
TMhelix
2346 - 2368
outside
2369 - 2602
TMhelix
2603 - 2625
inside
2626 - 2636
TMhelix
2637 - 2659
outside
2660 - 2662
TMhelix
2663 - 2685
inside
2686 - 2691
TMhelix
2692 - 2714
outside
2715 - 3014
TMhelix
3015 - 3037
inside
3038 - 3125
TMhelix
3126 - 3145
outside
3146 - 3148
TMhelix
3149 - 3171
inside
3172 - 3182
TMhelix
3183 - 3205
outside
3206 - 3219
TMhelix
3220 - 3242
inside
3243 - 3248
TMhelix
3249 - 3268
outside
3269 - 3287
TMhelix
3288 - 3310
inside
3311 - 3316
TMhelix
3317 - 3339
outside
3340 - 6591
