Strain
Bat_MN065811
(Region: Finland: Helsinki; Strain: Bat alphacoronavirus strain BtCoV/008_16/M.bra/FIN/2016, complete genome.; Date: 15-Aug-16)
Gene
polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGTCCAGCAACCAATTGACGTTGGCCTTTGCCAACGATCCAGAAATTTCAGCTTTGGGCTTTGCCAGCTCTAGTGAAGCCGTCTCATTCTACAGTGAGGCCGCGACTAGAGGTTTTGTGCAATGCCGCTTTGTGTCTTTAGGCCTTCAAGATATTGTCGAAGGAGTTGCTGACGAAGACTTTGTCATGGTTGTGACAGGTGTCACGCAGCTTCGTGCCTATATAGACACTTTTGGTAGCCGACCTACAAATCTTAGAGGTTGGTTGCTTTTTTCAAATTGTAATTATTTCCTGGAAAACCTGGATTTAATTTTCGGACGTCGTGGTGGTGGTGCTGTTCCTGTTGATCAGTACATGTGTGGTTCTGATGGCAAACCTGTTCTTCAGAAGGCCGATTGGGAATACATGGATTATTTTGGTGATGCTGAGGAATTTATTCTCTACGGCATTACCTATGTTAAGGCATGGATTACTGAGCGCGCTGAAGTCAGTTATGAAAGTCAGAATCTTTCGACCATCCTGCGTATACAATATTGTTCTACTTATGTACACACTCTTGCTGATGGTACTGTCATGAAAATGGCAAGTAAGGCCAAAGTTAAGAAGAGTGTTGTTTTGAGTGAGCCATATGATAAAATCTACAGAGATGTTGGGTCACCTTTTATGGACAATGGTAAGAACATCCGCCAGGCCGTTAGGAAACCAGTGTTTCTTCATGCCTTTATTAGATGTAAGTGCGGTGTCACCCAGTGGAGTGTAGGCGATTGGAAGGGTTATAAATCACCATGTTGTGGTGTATTTTGTAAACCCATTTCCACTGTTGCTGCCTCAGCTGTTCCGGGCGCTGTTGTCCTCACAACTGAAGGTGCAGGTAGTGGCATCAAGTATTACAATGGCCTCTTCTTGCGCCACCTTTGTGATGTGGATGGGCTAGGAGTTTGGCGCCTTATTAAGGTTCAGTCAAATGGAGACTTGGTTGTCTCAGGTCAGACTGTTGAGCACGATGGGCTTATGGACCCTTGCTACTTCCTAAATGACGGCAATTTGGCTACTGATTTTAAGGTCGCTATGTTAAGTGGTGACTTTAGTCACAGTGTGAAGCAGGCCATAGTTGCTGGTCATCTTAGTGTTGGCAGTCAACTTATTGATGTCACGGAGGATGTCATGGGAACACCCTGGTTTGTACGTAAACTTGGTGACTTATTCTCTGGTTGTTGGCAAACTTTTATTGAGTTTGTGCGCTCGCTTAAGTTGCACACAAGTCAACTTGTAGACTTGTCAAAGCGTCTTGCTTGTGCTAGTCTTAGCGTTCTTGATGGCGCATTTAAATTAGTCCTGGATGTGCCAGCAGCACTGCAATGTTGTGTTGACAAACTTGTTTCATTGTTTGAGACTCTGTTTTCTGCAACTTGTGATGCTGTGGTTGTTGGCGGCAAATGTTTTAGCAAGGTTGGCAATTATGTCCTCCTTGATAACGCACTTGTCCGTCTTGCTAAGACTAGAGTTAAGGGTCCCAGACAAGCCGGTGTTAATCATGTGAATTATGCGAGTGTTGTTCTTGGCCCTACTTATAAGGTTAAATCTTCTAGGGTTGAGTCCTACAAGGTTAATCTTGTCCTTGTAGATGAGCCTGTGCCTGTGGCTACTACTGGCCACGTTGTCATTGTGGATGGCATGGCTTTCTATTGCTCAGATGGTTTTTACCGCTTTATGGCTAATGAGGAAACTGTTCTTGAAGAACCAGTTTTCCGTGACATAGAGGACTTCAAACCAGTTTTTGAGTGTGAGCCTATAGATGGTTTTCCTACTGTTGTCGCAGGTAATGTTGTTGAACTCTGTGTTAAGGTTGATGACCTTCTCAAAAATTATGACACTGTATATAGGAAATATAGTGCTATAATTAAGGGTGAGAAGTGTTGTATTACATGTGTCTACGATTTTCATGCACCTCCATATATAACGGACGTTGAACGTTTTGTGGAATTGTGTGAGGATTGTGTTGGTAATTCAGGGTTCCATGAGTTTTACACTTCTGCGCATGAAGTAGGGGACTTGGCTGCCTTTGTCACTCAGTGTTGTACCATGGAAGGCTTCGAGTGTTTTAGGCCCATTACTCCTGAATGTCCCCAAATCTTGGTAGAGATCGATGGTGGGTCTATATGGCAGTCTTTTCTAGCTGGTTTAAAATCTGCAGCAGATTTTATCAAGCATCTTAAGATAGACTTTGGGCTTGAAGGCATTGTTGTTAGCGTTTTAAAACGCTTTAAGAAGGCGGGTGCATTGCTTGCTAAGTTATATAACACCTTTTTGGACAGTGTTAGCAGTTGTTTGAAGTTGGCCGGTGTTAGCTTCAAGTATTATGCTACAGCAATACCAAAAATTCTTATTGGTTCCTGTTATCACAGTGTTAGGGATATTAAAGTTGATGAACTAGATATCCCGGCTGAAAGTGAACTCTTACAGTTTAAGGCCTTTGATCATTGTACATTCCCTGTAACACCTAAGCGTGTGGAAGTGGAGTCAATTGAACTTGAGGAGATCCACTTTGTTGAACCCCGGGATTTTGGTAAGTTGTCCATAATTGATGGTTATGCTTTTTATTGTGATGGTAAACGTTACTATCCTTCTAGTATTGACAGTGTTGCACCTGTTTGTTACCAAAAGAAGTGTGGTGGTGTTGTTAAAATTTCTGATGAAGTGCAAGTCAAGGCAATAGACCCTGTGCATAAGGTGCGTCTCGAGTTTGAATTCGAGGATGATACTCTTATGCAGATTTGTTCCAAGATAGCCGGTACATCCATAAAAATTACCGGTGGTTGGGACAAATTGCTTGACACAATTGATGTAGCCATGGCTTTGGTTAAAGAATATGTTGATGTTCCTACCTATTTTGTCTATGACGAACAAGGTGGTACAGACATAAGTCTTCCAGTTATGGTTTCTCAATGGCCATTGTCAGAACAGGGCGAAGAGCCACAATCCCAACCCTCTGATGAATCGGAGGTTGAGAGCGATTGTGACAGTTTAGAGGCTGCTGAGTCTAAGTCTGATGATCAACTTGAAGTTGAGCAGGCATTAGATTATATGGCCGACGTAGCACCTGTGACACCACCTAAGGACTTGTTTGCATTTGATTTCGCCAATTATGGTGGGCTCAAGGTTCTCAACTTGCAGCAGAACAATTGTTGGGTGGCGTCTGCACTTATACAAATTCAGCTTTTGGACCTTCTTGACGATCCAGTTATGGAACTTTTTAAAGTTGGACGTGTTGCGTCTATGGTCAAGAAGTGCTATGAAGTTGAAGGTGCTATCCTTGGTTCTCTAGGTGACACTTCCTCATGTTTGGAGAAGTTGTTGAAACATAAGGATAGTCTTACTGTTAAGTGTAGTGTGACCTGTGATTGTGGTGTTAGTGAACGCATTTATAAGGCTGCAACCTTGCGTATGACTCCTACTATGGACCCGTTCTCTTATGGCGCTTGTCCCAATTGTGCACAGGCGTTAATACATACGTTTGTGTCAATTAAAGGTACTGGTGTCTTTTGTAGAGAACCTACTGAATTAGATGTTGAGCAATTGGTGGTCAAACCCATTTGTGCCTCGGCCTATGTTGGAGCCAAGGACAATGGTCACTATTTGACTAACATTTATAGTTGTGCTATGAGTGTTGATGGTAATGGTCGCCACCCTATAACTCATTCAACACTTAACACTATTTGTGTTAAGGATGTTGACTGGAAAAAACCTATAGAAGTTACACCTTTACCGACTCAACCCACTCCTTTTATTACGTTTAAGAATGTGGAGTTTTATCAAGGTGATTTTAAGGACCTTATTGCAGTGCCACATGACTTTGTTGTTAATGCTGCTAATGAGAAACTTTCTCATGGTGGTGGTATAGCTCTTGCTATAGACACCTACACTGGCGGTTTGCTACAACGTTTGTCTGACTCACATATTAGGACGCATGGTAGCCTTAAGGTTGGTGCTGGTGTGATGCTGCATTGCGGGAACAACAAGATCTTCAATGTTGTTGGACCTCGTAAAGGAAAGCATGCACCTGAGCTACTTGTTAAGGCTTACAATAGTGTCTTCTCTCAACAGGGCGTGCCACTGTTGCCTCTGCTTAGTGTTGGAATTTTTAGAGTTCCTATTAGAGATTCTATTTCTGCCCTGTTTGCTTGCGTTGGACAGCGTGTTTGCCGTTGTTTTTGTTATGGTGATGAAGAGCGTGAGGCCATCATTGACTATGTCTCCAGTTTAACGCAATTGGAGCCACAGCCAGTTCCACCTGTAGTTCAAACACTTAAAATTTCGGAAGCTACACCATTTAGAGTTGAGGGTGATGTGAATTTCTATGATGTTCAACCTAAGTCACTGTTGTGTCTAAAGGCGGACAGGATAGTTGCTTTCACAACCCCTGATTTGAAGTTTTGTGCTGCTCTTGAGGCTTTTGATGTTTGCCTTAATGGTGGTTTGAAGGCTGTGGTATCAGATTACCTAAAGGGTAATACTATTGTGCCAGCTGGTAATTGTGTCACTTTTAAGTGTGACAGCTCCGTCACATTTACTATGGTGGTACTGCCTGTGGCTTCCAGTGATGGTTATAGTAAGAATTACCAGAGGGCATTAAATAAGTATTTTAAGTTAAAAGGCACTTTGTTGGTGGCTGTTTCAAATCCCGATGTTCTTAAAGACATTTTGCACCACGCAGTCCTTGGTTATATTACAACACCTGCTGTTGTTGATGTTGTGTATACTAAGGAACCTGTTGTTTTGAATGTTACTAGTGACAACCGTAGCTTCTATGCTAAGGTTCTAGATTCAAGTAAAACATTGGGTGACCAGCTTGGACCTTGTGCTATTGGAGGTGAGAGTTCAGTTGGGACTAAACCTGTTCAAGTTAACAAGGATGTTTTCATTGTGCCTGATGTAAACTGGGAAGCTCACTATGGTTTTAGAGATGCTGGTATCTTCCATGCACTTGACCATAGTGCTTT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Protein
MSSNQLTLAFANDPEISALGFASSSEAVSFYSEAATRGFVQCRFVSLGLQDIVEGVADEDFVMVVTGVTQLRAYIDTFGSRPTNLRGWLLFSNCNYFLENLDLIFGRRGGGAVPVDQYMCGSDGKPVLQKADWEYMDYFGDAEEFILYGITYVKAWITERAEVSYESQNLSTILRIQYCSTYVHTLADGTVMKMASKAKVKKSVVLSEPYDKIYRDVGSPFMDNGKNIRQAVRKPVFLHAFIRCKCGVTQWSVGDWKGYKSPCCGVFCKPISTVAASAVPGAVVLTTEGAGSGIKYYNGLFLRHLCDVDGLGVWRLIKVQSNGDLVVSGQTVEHDGLMDPCYFLNDGNLATDFKVAMLSGDFSHSVKQAIVAGHLSVGSQLIDVTEDVMGTPWFVRKLGDLFSGCWQTFIEFVRSLKLHTSQLVDLSKRLACASLSVLDGAFKLVLDVPAALQCCVDKLVSLFETLFSATCDAVVVGGKCFSKVGNYVLLDNALVRLAKTRVKGPRQAGVNHVNYASVVLGPTYKVKSSRVESYKVNLVLVDEPVPVATTGHVVIVDGMAFYCSDGFYRFMANEETVLEEPVFRDIEDFKPVFECEPIDGFPTVVAGNVVELCVKVDDLLKNYDTVYRKYSAIIKGEKCCITCVYDFHAPPYITDVERFVELCEDCVGNSGFHEFYTSAHEVGDLAAFVTQCCTMEGFECFRPITPECPQILVEIDGGSIWQSFLAGLKSAADFIKHLKIDFGLEGIVVSVLKRFKKAGALLAKLYNTFLDSVSSCLKLAGVSFKYYATAIPKILIGSCYHSVRDIKVDELDIPAESELLQFKAFDHCTFPVTPKRVEVESIELEEIHFVEPRDFGKLSIIDGYAFYCDGKRYYPSSIDSVAPVCYQKKCGGVVKISDEVQVKAIDPVHKVRLEFEFEDDTLMQICSKIAGTSIKITGGWDKLLDTIDVAMALVKEYVDVPTYFVYDEQGGTDISLPVMVSQWPLSEQGEEPQSQPSDESEVESDCDSLEAAESKSDDQLEVEQALDYMADVAPVTPPKDLFAFDFANYGGLKVLNLQQNNCWVASALIQIQLLDLLDDPVMELFKVGRVASMVKKCYEVEGAILGSLGDTSSCLEKLLKHKDSLTVKCSVTCDCGVSERIYKAATLRMTPTMDPFSYGACPNCAQALIHTFVSIKGTGVFCREPTELDVEQLVVKPICASAYVGAKDNGHYLTNIYSCAMSVDGNGRHPITHSTLNTICVKDVDWKKPIEVTPLPTQPTPFITFKNVEFYQGDFKDLIAVPHDFVVNAANEKLSHGGGIALAIDTYTGGLLQRLSDSHIRTHGSLKVGAGVMLHCGNNKIFNVVGPRKGKHAPELLVKAYNSVFSQQGVPLLPLLSVGIFRVPIRDSISALFACVGQRVCRCFCYGDEEREAIIDYVSSLTQLEPQPVPPVVQTLKISEATPFRVEGDVNFYDVQPKSLLCLKADRIVAFTTPDLKFCAALEAFDVCLNGGLKAVVSDYLKGNTIVPAGNCVTFKCDSSVTFTMVVLPVASSDGYSKNYQRALNKYFKLKGTLLVAVSNPDVLKDILHHAVLGYITTPAVVDVVYTKEPVVLNVTSDNRSFYAKVLDSSKTLGDQLGPCAIGGESSVGTKPVQVNKDVFIVPDVNWEAHYGFRDAGIFHALDHSAFAFDNDVVSGKRVLKTTDNNCWVNVTCLQLQFANAKFNSKGLQALWESYCVGDVATFCHWLYWITNVNKGEPSDSENALNVISKYLCVQGSVELHTTTRFRDSCDNSCTSTRVVSTPVVNVSLLRLGMEDGVCKHGETRITRVSAVKGTVILVNPGKPLLATPEMYLDGVSYTMFTDNGIGVGHYTVFERSTGLAFDGDTRRPSDIATSHITNMVVSASNNVVFEEPAKKAEFDMAKFMDKMNYASEKFFTFGDFVSRNILTVLVYLMSILSLCYKSFKKRDLKVLAGVPQRTGIIFRKSVKYNVKALGFFFKIKFYWVKQFLKLCLCLYTIYSLAFMFIRFTPIGGPLCDGYVEGYANSTFDKNEYCDSVLCKICLYGYQELSDFSHTQVVWQHLKDPLIGNIMPGIYLAFLTIFGDFYARIVAFYFFLQYFNSFGVALGYQDSVWFLQAIPFDVFGDEILVSFIVIRVLLFLKHVLFGCDKPSCVACSKSAKLTRIPLQTIFQGTSKSFYVHANGGKKFCKKHNFFCVDCDSYGPGCTFINDVIAPEVGNVVKLNVVATSPATIEIDKVEFSNGFYYLYSGSTFWKYNFDITEGKYSCKEALKSCNITTDFIVYNNNGSNFAQVKNACVYFSQLLCKPIKLVDSALLASLNVDFSANLHSAFIGVLNNSFGKDLSNCATMSDCRNALGFDEVSDEDFNAAVSEAHRYDVLLTDISFNNFFTSYAKPEEKLPVHDIATCMRVGAKVANHNVLTKDNLSVVWLVRDFMALSDETRKYLVRTTKVKGINFMLTFNDRRMHTSIPVVNIANKKGAGFPTLFSKCYKFFWYFCVLVVLLFFSLSFYDFSIQVTSISDYDFKYIERGVLKDFHKPLSCVHNVFDNFDSWHHAKFGSTPTHGRSCPIVVGTSDEARTVPGVPSGVYLVGKTIVFAMNTIFGSSGLCFDERGVANKGSCVFNAACTTLTGIGGTAVYCYKDGLVEGSRLYSDLLPHSHYKLADGNNIILPEIISRGFGFRTVKTRELTYCRVGQCMDSKEGVCIGRDTFFVYTTGAGSEFVCGNGLFSLLFNLFSIFSKSVPVMVLSGQILFNCIVAFLAVSACFIFTKFKRMFGDMSYGVFTVGCCTIICNLSYVVTQNYLGMLAYALIYFLSTRGVKYSWIWHTGFCVSYCLMAPWWLLLWYFASAVLDFMPNLLKLKVSTQLFDGDKFVGSFESAASGTFVLDMHSYERLANSISSDKLKQYASTYNKYKYYTGAGNEADYRLACFAHLAKAMMDFCNSHQDQLYTPPTVSYNSTLQSGLRKMAQPSGIVERCIVRVSYGNMVLNGLWLGDTVICPRHVIASNTNTLIDYDKELSLVRLHNFSVSYGNMFLGVVGVTMRGALLHIKVNQANVNTPNYTYRTLRPGESFNILACYDGSASGVYGVNMRTNHTIRGSFINGACGSPGYNLSGGVVEFCYMHQLELGSGCHVGSDMDGVMYGGHQDQPTLQIESASSLITENVLAFLYGALINGCNWWLSASRLSVEKFNEWAIHNGMTTIGNLDTYSILAAKTGVDAQRLLASIQALQRNFGGKEILGYTSLTDEFTTAEVIKQMFGVNLQSGKISRAFRNVVIIGAFITLFWTELVAYTKFFWVNPGYVTPMFLCITVLSSLLMLFLKHKLLFLQMFLLPSVVIAAAINLAADFRVYAYLEEHLDYHVSLMGFNAQGLLNIGLCIVVMLLHTFRFARSSTHWVTYLVALLSACYNYFYMNDALSCAITLFSSLTGHWFIGALVYKLAVIVVAQFPIILVTFEQAKGVVICYLALGYLFCMFYGVLYWVNRFFKLRLGVYDFMVSPVEFKYMVANGLKAPRGVFDSMILSLKLIGVGGDKCIKVSSVQSKLTDIKCTNVVLLGCLTSMNVNSNSAEWAYCVDLHNKINLCNDAVEAQEMLLALLAFFLSKNSAFGIDDLVDSYFNDNAMLQSVASTYVNMPSYIAYESARQSYEDAVANQSPPQLVKQLRHAMNVAKDEFNREASTQRKLDRMAEQAAAQMYKEARAVNRKSKVTSAMHSLLFAMLRRLDMSSIDVILQLAKDGTVPLSVIPALSATKLTIIVSDIESYNRLQREGCVHYAGVIWSVLDVKDNDGKAVHVKEITTQNSDSLAWPLFLNCERIVKLQNNEIIPGKLKQRAMKAEGDGFVADGKALYNTEGGRTFMYAFISDKADLKVVKWEYEGGCNTIELEPPRKFLVESPTGPVIKYLYFVCNLNNLRRGAVLGFIGATVRLQAGKQTEHATNSSVLTLCAFSVDPAKTYIDAVKGGHKPVGNCVKMLSNGSGNGMAITNGVEATSNQDSYGGASVCLYCRAHVEHPAMDGICRLKGKYVQIPIGTQDPIRYVLENTVCKVCGCWQANGCACDRSTLQTTLDHWLFKRVRGSSAARLEPCNGTDTQHVYRAFDIYNKEAACISKFLKVNCVRFKNLDLHDAFWVVKKCTKSVMEHEQSIYELISDCGAVAKHDFFQWKEGRSIYGNVCRKDLTEYTMMDLCFALRNFDESNCDTLKKILVIVGACDETYFENKSWFDPVENEDIHRVYSILGKVVARAMLKCVAFCDAMVEKGIVGVVTLDNQDLNGNFYDFGDFVVTVKGMGVPVCTSYYSYMMPIMGLTNCLAAECFIKSDIFGDDFRTYDLLEYDFTEHKLKLFSKYFKHWGQVYHPNCVDCYDEQCVVHCANFNTLFATTIPLTAFGPLCRKCWIDGVPLVTTAGYHFKQLGIVWNKDLNVHSNRLTINELLQFCADPALLIASSPALVDQRTVCFSVAALSTGMTSQTVKPGHFNKEFYDFLRGHGFFDEGAELTLKHFFFAQRGDAAIRDFDFYRYNRTTVLDICQARVVYQIVQRYFDIYEGGCITAKEVVVTNLNKSAGFPFNKFGKAGLYYESLSYDEQDELYAYTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQYHQKHLKSIVNTRGASVVIGTTKFYGGWDNMLRTLIGDVENPNLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHVTCCNTSDRFYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYLKPGGTTSGDATTAYANSVFNIYQAVSANVNRLLGVDSNTCNNLEVKQLQRKLYDCCYRSSNVDASFVDEYFGYLRKHFSMMILSDDGVVCYNSEYAAMGYVADLSAFKAVLYYQNNVFMSASKCWIEPDINKGPHEFCSQHTMQIVDKDGTYFLPFPDPSRILSAGVFVDDIVKTDPVILLERYVSLAIDAYPLSKHENPEYRKVFSVLLDWVKHLYKTLNQGVLESFSVTLLEDATAKFWDESFYANMYERSAVLQSAGLCVVCSSQT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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR027351
(+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR036499 NSP9_sf
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR014829 NSP8
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR042515 Nsp15_N
IPR014827 Viral_protease
IPR009466 NSP11
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR014822 NSP9
IPR037227 EndoU-like
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014828 NSP7
IPR027352 CV_ZBD
IPR036333 NSP10_sf
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR037204 NSP7_sf
IPR008740 Peptidase_C30
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IPR037204 NSP7_sf
IPR008740 Peptidase_C30
SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1177 Identity=60.15%
Cov(Q)=13.73% Cov(P)=96.96%
3D Structure
Ontologies
GO
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0019079 P:viral genome replication
GO:0019082 P:viral protein processing
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host membrane
Host perinuclear region
Host membrane
Topology
Length:
6743
Number of predicted TMHs:
18
Exp number of AAs in TMHs:
419.795839999996
Exp number, first 60 AAs:
0.00054
Total prob of N-in:
0.00034
outside
1 - 1921
TMhelix
1922 - 1941
inside
1942 - 1987
TMhelix
1988 - 2010
outside
2011 - 2065
TMhelix
2066 - 2083
inside
2084 - 2089
TMhelix
2090 - 2107
outside
2108 - 2116
TMhelix
2117 - 2139
inside
2140 - 2490
TMhelix
2491 - 2513
outside
2514 - 2585
TMhelix
2586 - 2608
inside
2609 - 2707
TMhelix
2708 - 2730
outside
2731 - 2744
TMhelix
2745 - 2767
inside
2768 - 2779
TMhelix
2780 - 2802
outside
2803 - 2821
TMhelix
2822 - 2844
inside
2845 - 3268
TMhelix
3269 - 3291
outside
3292 - 3295
TMhelix
3296 - 3318
inside
3319 - 3322
TMhelix
3323 - 3345
outside
3346 - 3359
TMhelix
3360 - 3382
inside
3383 - 3393
TMhelix
3394 - 3411
outside
3412 - 3430
TMhelix
3431 - 3453
inside
3454 - 3457
TMhelix
3458 - 3480
outside
3481 - 6743
