Strain
Bat_MN611524
(Region: China; Strain: Miniopterus schreibersii bat coronavirus 1-related isolate 161454, complete genome.; Date: 18-Mar)
Gene
orf1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
orf1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGTCGTCCAACCTTGTGACATTGGCTTTTGCCAGTGATTCGGAGATTTCTGCAGAGGGTTTCTGTGATGTTAGTTCTGCCGTCTACGCTTTTAGCGTGTCCGCAGCTAACGGTTTCACAGATTGCCGTTTTGTGGCCCAAGGCTTAGAACATTGCCTTGTTGGTATTGAAGCTGATGACTACGTCCTGTGTGTAACAGGCGATGTTCAGCTTAAGGCATATATTGCCAAATTCTCGGACCGTCCTCTAAACCTTCGTGGTTGGATCGTCCGTTCTAATTCAAACTACTTTCTTGAAACCATGGATCTGGTTTTTGGCTGTGGTGGTGGCACTTCAATTCCAGTAGATAACTACATGTGTGGTGCCAACGGTAAGCCAGTTTTACCAGAAGATATGTGGTGCTTCTGCGACTATTTTGGTGATGAGGGAGATAACATCACTGTAAATGGTCAAGCCTATCATAAGGCATGGAATGTCACTCGTAGTGATGTCCCATACCAGTTTCAGAATGCTAGCACTATTCTTAGCATTGAGTACCTTGCAGACGAAAAACATGTGCTGCCTGATGGTGCTGTTGCTAAGACTGCTAAACCACCTAAATTCTCTAAGAACATCGTTCTTTCAGAGAAGTATAAAGCACTTTATGAGGCTTGTGGCAGTCCATTTGTCACTAATGGCACCAATGTCCTTGAGGTTGTAACCAACCCCATTTTTGCGCATGGTTTTGTGCAATGTAAATGTGGGTCTAAACATTGGACTACTGGAGACTGGGCTGGTTTCAAATCAGTGTGCTGTGGCATACCAGGACGTGTCTTGTGCACAGTCTTTGGTGGTGTTGCACCTGTTTCAGTTCTTCTGACGTCAATTAGAGTTGATGCAAAACCTGGTGCTGCGCGCTACTATCATGGATTAACACTCAAACACATTTGCAATGTGGATGGTGTTGCATGCTGGCGTGTTACCAAAGTTCAAGGTGTTGAAAGTTTTGTAGCTAGTGGTTCTCTTGAGGACTGTGTTGGCTCTACTTTCGATACTTGCACATATGACAATTACACTTCAGTTGCAAAGGCCTTTAAGTGTGGCATGTTAACTGGCAACTTTGCTGACGATGTTGTTGCTAGTGTTATTAATGGCACACTTGATGTTGGTCTTGCAGTGCTGGATGTAACTACAGCTGTTACCAAGCCATGGTTTGTGTTGAAGTGTGGTTCACTTCTTGAATCTGCGTGGGACGCACTCATAATGGCCGTTAAACAGTTACCTGTTATGGCTAGTGATGTGCTGAAATTCTTTAATAACCTCAGTCAAGTTCTGATTGTTGTTAGAGATGGTGTCATTGACATCATTCATTCTGTGCCTGAGGCTTTTAGAAGTGTCTTTGAGATCTTTAAAGATCTTGTGTCTGGTGTGTTTGACCTTGTTGTTGAACACTTTAAAATTGCCAACAAGAAATTCAAGCGTGCTGGTGACTACATCCTTTTCGAAAATGCACTTGCCTGTCTTGTCAGTGCGAAAGTTAAGGGTGTTAAGCAGGCTGGTCTTAAAAAGCTTCTCTATGCTAAAGCTGTCGTTGGTGCTACGGTTAAAGTTACTGTTAGCCGTATTGAAAGTGCAACTGTTAAACTCGTTGAGTGTAAACCATCCAAATTTGTGAAGAAGGGCAATGTTGTTGTTATTAACGACATAGCATTCTTCCACAGTGATGGTGTTTACAGACTGATGAGTGACAGTGACGAGGTCTATGAAGACATTGCTTTCACTGCTGAAGGTGTTTCCACAGTTAAGAAGCCAGTCTTTGATTGTAACAAACCAGTTGACTTTCCTGATATCAGTAGTACTGATGTTGAAGTACTGGTTCGTGAGGTCAGAGCTGCTCTTGGCAAATTCTCTAGAATCTATGACAAATACAGTTGTGTTGTCAGAGATGGAGAATGTGTTGTCACACACAAGTATGTCTTCAATGCACCTAGCTTTGTTGAAGACAAGGCTATGTTTGTTGACCTCTGTAAGGATTATGTCACAGATATTGGCTTTGAGGCATTTTATGCTAATGCCATTGTTGCCAATAACTCTGATGAGTTTAATCCAGTTTACTCAGCTTTTGAGGTTTTTAAAACCAAAGTTGAGTGCCCTGAAGAACTTATGAATATTGATGGCGGTTCTATTTTTGGAACTTTCATCAATACAGTTAATGATGCTGTGAACTTTGTCAAATCGTTGAAGATAACGGTAACAGCTACTGAAGTCATGATTAACACTGTTAAGCGATTCAAACGCTTTGCCAGTGCCCTTGCTAAGCTATATAGTGAGTTCATGAATACTGTTAAGAATATCATTTCTATCGGCAGTATCAAATGTTACCACTATGGCTTTGTGAAACCTGTTCTAGTGATAAAAGACGTCTTTTATCGCATCTATGATGCTGCTGTAGACACATTCAATGTCGCTGTTGAAGCAGGTCTAAACACTGTTAAGACTTTCAGTGGTGGTGAAAATCCTATCACTTTCTCACGTGTTGAAGTTGCTAGTGTCGAGCTTGAACATGCTGAATACGTCAAGCCCGAAGCTAACGGTCATGTTAGTGTTATCAATGGACACACATTTTACACATGTGGTGACTATTATTACCCTTGTGACCAGAACAATTGCTTCTCACAGTGTTTTAAGAAGGTTGGTGGATCTGCTGTTACATTCTCTGAAAAAGTTGCTGTCAAACAAATTGACCCTGTTTACAAAGTAAAACTTGTTTTCGAGTTTGAAGATGACACTATTAGTAGTGTTTGTAAGCAGGCAATTGGTAAATACATCTCTTTTGAAGGCAATGACTGGTCCAGCTTTGAGGAAACTATTCATAACGCTATGAATGTTGTTGGTGAATTCGTAGACCTACCTGATTACTTCATCTATGATGAGGAAGGTGGTCATGACTTAACTAACACTGTTATGATTTCTCAATGGCCAGTGTTTGATCCATCAGCACTACAACTTTTAGTTGCTGATTTGGGTGTCAATTGTGACTTCAATGGTAAGTCTTCCATTGAAGAATGTCTGACTTCTGTCTCTGACACTGTTCTTTGTGTGTCATTGGAGAAGTCATGTGACTGTGGCACCTTCAATGCTATAATGGAAGGTTTTGCACTTGATTTCAAACCATGCACTGATAGTGATGTCTGTGACAACTGTGGTGGTCTTTGCACTACTACAGTTTTGAGCATGACTGGTACTGGTTTTGTGCGTTCTTGTGATGAACCATTAGTGCCTTTCAATGTTACATTTGAAGGTTATGGTGTATACAAGGACGTTTGTTTTGTCAATGACACAGTGTTACCTCCTCCTTTTGACGAAGAGATCACACCTATTGAAGAAGAACTAGTAGTAGAAGATGTCATTGCAGTTGATGAAGTTGTTGATGTTGAAACTACTACACAAGTAGAAGAATTGACTGTTGTTGAAGCTGTTGAAGATGACATTGTCAAACCTGAAGAGGTTATTGATGTTTCTTCTGACATTGAAGCTGTTAACCAGGCACTTTCATTCATGAAACCTACAGAAACAAAGTTTGTAGACCCATTCAAGTTTGATTATTATGACCATGAGGGCATTCGTGTACTCAGACAAAATAATAATAATTGTTGGGTCGCTTCAACGTTGGTACAATTGCAACTTTCGGGCTTGTTGGATGATGATGACACTATGGCCCTTTTTAAGGCTGGTAGTGTGTCACCATTAGTTCGCAAGTGCTATGATGCAGTTGGAGCTATTGTAGGTAGTTTAGGTGATGCATCTCACTGTTTAGAAGTTCTTCTAAAAGATCTGCATACCATGTTTATCACTTGTGATGCCACTTGTGGTTGTGGTAGCAGTAGTTATGAACTTAGTGGTTCTGTTTTTAGATTTATGCCTACCAGAGATAGTTTTAGTTATGGTGCTTGTGGTGTTTGTGGTAAAACACTCAAGCTTAAGATTAAAACTATGACTGGTACCGGCTTCTTTTGTCAGGACCCAAAACCTTTTAATACTGCACGTGCTATTGTAAAGCCAGTTTGTGCTAGTATTTATCAGGGTTCTACTACTAGTGGACATTATAAAACCAATGTTTTTGGCAAAAGATTTTGCGTTGATGGTTCTGGTGTTAGCAGCATTTCTAATGGCCATATTAACACGATTCTTTTGAAGGATTGTAACTATGGCATTTCTGCTATTGCTGAACCTAAGCAAGAAAAAGTTGAGCAATTTGTCACACCTGAAGATGTTGGACAAGTTGTTAAACAAAAACCCAAGCCTTTCACTACTTATCGTAACATTGAATTCTACCAAGGCGATGTTTCTGAATTAGTTGGTCTTGACTTTGACTTTATTGTCAATGCAGCCAATGAAAATCTCAAACATGCTGGTGGAGTTGCAGCTGCGATTGACAAGCTTACTGGCAATGAATTGCAGAGTTTGTCAAATAAGTATGTAAAGACAAATGGTAAGGTCAAAGTTGGTTCTGGTGCCATGATACGTTGTAAGAAATACAGCGTACTTAATGTTGTAGGACCTAGAAAAGGTAAACATGCACCTGATCTCTTGGAAAAGTGTTACAGAACTATTCTTAAAGAGCAAGGTGTTCCTCTCATGCCTCTTATTAGTGTTGGTATATTTGGTATACCTCTTGCAACATCTTTCAATGCTCTATTGAACACGTCCAGTGGTAGAACGGTTAGATGTTTTTGCTACACTGATAAAGAGTGTAATGAGATTAAAACACTTGTTGCTTCTCTTAATGAAGAACAAGTTGCAGCTACTGTTGAAGAAACAGTTGTAGCTGAAGAAAAGCCTATTGCTGACTTAAATAAAACAGCTGTTGAAAAACCTGCTGAAGAAAAGTCAGTTGAAGCTGAGAAAATTGCTACCGAGGAGGTTAAAGAACCTTTGGTAGCTGAGAAAGTCATTGTTGAGGTAAAAGAACCTGTTTTAAAGGTTGCTGGTGTGTCTTATTATAATATTGAAGACAGTTT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Protein
MSSNLVTLAFASDSEISAEGFCDVSSAVYAFSVSAANGFTDCRFVAQGLEHCLVGIEADDYVLCVTGDVQLKAYIAKFSDRPLNLRGWIVRSNSNYFLETMDLVFGCGGGTSIPVDNYMCGANGKPVLPEDMWCFCDYFGDEGDNITVNGQAYHKAWNVTRSDVPYQFQNASTILSIEYLADEKHVLPDGAVAKTAKPPKFSKNIVLSEKYKALYEACGSPFVTNGTNVLEVVTNPIFAHGFVQCKCGSKHWTTGDWAGFKSVCCGIPGRVLCTVFGGVAPVSVLLTSIRVDAKPGAARYYHGLTLKHICNVDGVACWRVTKVQGVESFVASGSLEDCVGSTFDTCTYDNYTSVAKAFKCGMLTGNFADDVVASVINGTLDVGLAVLDVTTAVTKPWFVLKCGSLLESAWDALIMAVKQLPVMASDVLKFFNNLSQVLIVVRDGVIDIIHSVPEAFRSVFEIFKDLVSGVFDLVVEHFKIANKKFKRAGDYILFENALACLVSAKVKGVKQAGLKKLLYAKAVVGATVKVTVSRIESATVKLVECKPSKFVKKGNVVVINDIAFFHSDGVYRLMSDSDEVYEDIAFTAEGVSTVKKPVFDCNKPVDFPDISSTDVEVLVREVRAALGKFSRIYDKYSCVVRDGECVVTHKYVFNAPSFVEDKAMFVDLCKDYVTDIGFEAFYANAIVANNSDEFNPVYSAFEVFKTKVECPEELMNIDGGSIFGTFINTVNDAVNFVKSLKITVTATEVMINTVKRFKRFASALAKLYSEFMNTVKNIISIGSIKCYHYGFVKPVLVIKDVFYRIYDAAVDTFNVAVEAGLNTVKTFSGGENPITFSRVEVASVELEHAEYVKPEANGHVSVINGHTFYTCGDYYYPCDQNNCFSQCFKKVGGSAVTFSEKVAVKQIDPVYKVKLVFEFEDDTISSVCKQAIGKYISFEGNDWSSFEETIHNAMNVVGEFVDLPDYFIYDEEGGHDLTNTVMISQWPVFDPSALQLLVADLGVNCDFNGKSSIEECLTSVSDTVLCVSLEKSCDCGTFNAIMEGFALDFKPCTDSDVCDNCGGLCTTTVLSMTGTGFVRSCDEPLVPFNVTFEGYGVYKDVCFVNDTVLPPPFDEEITPIEEELVVEDVIAVDEVVDVETTTQVEELTVVEAVEDDIVKPEEVIDVSSDIEAVNQALSFMKPTETKFVDPFKFDYYDHEGIRVLRQNNNNCWVASTLVQLQLSGLLDDDDTMALFKAGSVSPLVRKCYDAVGAIVGSLGDASHCLEVLLKDLHTMFITCDATCGCGSSSYELSGSVFRFMPTRDSFSYGACGVCGKTLKLKIKTMTGTGFFCQDPKPFNTARAIVKPVCASIYQGSTTSGHYKTNVFGKRFCVDGSGVSSISNGHINTILLKDCNYGISAIAEPKQEKVEQFVTPEDVGQVVKQKPKPFTTYRNIEFYQGDVSELVGLDFDFIVNAANENLKHAGGVAAAIDKLTGNELQSLSNKYVKTNGKVKVGSGAMIRCKKYSVLNVVGPRKGKHAPDLLEKCYRTILKEQGVPLMPLISVGIFGIPLATSFNALLNTSSGRTVRCFCYTDKECNEIKTLVASLNEEQVAATVEETVVAEEKPIADLNKTAVEKPAEEKSVEAEKIATEEVKEPLVAEKVIVEVKEPVLKVAGVSYYNIEDSFAVGADNIVILTNSKLELGKIGECIDKHSDGALKLAVSEYLSQTPNVPPGNVISMRCSGLATVVFAVVPSDGDVQYVKNVKRTISKLSKLRGSSVCSFSTLDMHKRLLNLFSKFCVDNIDDIKDIHDTKTTIKVSLDGRNVVDVDVAADQTIGEQLNACTTDNVIISDSVVTDVIDTIVNVAPEVDWDSFYGFPHAAEFHMLDHGAYAFDSDVVDGKRALVGTDNNCWINAVCLQLQFAEADFTSEGLKDMWNEFLVGNVAKFCHWIYWLVRANKGDAGDAENALNMLNKYVKAHGTVTLTRETAEGCCVNEHRINSFVVNASVLRSGCNDGYCKHGNAYIARVSKVDGVSVIVNVDRPSVMSDNLLLSGTSYTAFSGPMDSGHYRVFNPVTSKMFDGANCVGGDLCNLAVTAVVIKNKVFKIQTADNNTPVKIIKKLDDASEKFFSFGDIVSKNVCNSIIWFFTMLSIIFKAFKTRDFKVFALAPERTGVILSRSLKYNLKAAQHVLRRKQTYVKRFFKFSVIAYTLYALSFMFVRFSPANDYFCKDHVEGYSNSTFVKDEYCASTMCKVCLFGFQELADLPHTKVVWKYVGFPIFVNWLPFLYLAFLFTFGGIFVKGLVCYFFAQYVNTLGVYFGMQEKFWPLQIIPFDIFGDEIVVTFIVYKALMFIKHVCFGCEKPSCVACSKSARLNRVPMQTIVNGANKSFYVVANGGSSYCHKHKFFCLNCDSYGPGNTFINETVARELSNVVKTNVQPTGESFIEVDKVSFENGFYYLYSGETFWRYNFDVTEAKYGCKEVLKNCNVLSDFIVYNNNGTNVSQIRNACVYFSQMLCKPIKLVDATLLSTLNVDFNGALHSAFVQVLNDSFSKDLSNCASMTECKQALGFDVSDEEFVDAVSNAHSFNVLLSDNSFNNLLTSYAKPEEQLSTHDVATCMRFNAKVVNHNVLIKENVPIVWLARDFQQLSEEGRKYLVKTTKAKGVTFLLTFNTNAMNVKLPAISIVNKKGAGVSSSFLWWLCAAIITFFFCVGISEGLIATSLEGFGFKYIKDGVMHDFDKPLSCVHNVFDNFNSWHEARFGSIPSNSLKCPIVVGTLDDVRNVPGVPSGILLVGKTLVFAIKAVFTDAGNCYGLNGLTNAGACLFNSACTKLEGLGGTHVYCYKDGLFEGSKRYSDLVPHSNYKMEDGNFVKLPETLVNGFGINIIRTMETTYCRVGECLKSKAGVCFGANRFFVYNDDFGSDYICGNGLFSFVKNLFNTFTMSLSVMALSGQVIFNCAVAALAIFICFLVVKFKRMFGDLSYGVCSVIAAVTINNLSYVFTQNMLFMFVYATFYFLAVRNLNYAWIWHASYVVAYFNMAPWFIIVWYVVAMLTGLLPSVLKLKISTNLFEGDKFVGTFENAAFGTFVIDMHSYEKLVNSITPDKLKQHAAMFNKYKYYSGSASEADYRCACFAHLAKAMTDYASSHQDMLYSPPSISYNSTLQAGLRKFAQPSGVIEHCIVRVSYGNMVLNGLWLGDEVICPRHVIASSINSAIDYDHEYTMMRLHNFSVSSGNLFIGVVSAKMRGASLVIKVNQNNPHTPKHVFKTLRAGDAFNILACYDGVPSGVYGTILRHNKTIRGSFINGACGSPGFNINGDTVEFVYLHQLELGSGCHVGSNMEGVMYGGFDDQPSLQIEGADCLVTVNVIAFLYGAILNGCTWFLSNERVSAEVFNGWAHDNNFTDVGSLDCFNILAAKTGVDVQRVLASIQKLAKGFGGRNIIGYASLTDEFTVSEVVKQMYGVSLQSKRVPSIFNNVTLVSVFWSMFLSELLYYTSSYWIKPDLITAVFVLLFGIAVMLTLTIKHKVLFLYTFLIPSVVISACYNLAWDLYIRELLAKYFDYHMSIFSMDIQGCFNIVACILVNAIHTWRFVKTGTATRLTYVLSLVVSVYNYWCCGDFLSLSMMVLLNINNNWYIGAIAYRFSVVVVNYMDPSVIRMLGGVKVILFMYVTCGYLCCMYYGICYWFNRFFKCTMGLYEFKVSPAEFKYMVANDLRAPTGAFDSMSLSLKLMGLGGERTIKISTVQSKLTDIKCTNVVLMGCLSSMNIEANSKKWSYCVDLHNKINLCDDAEKAMEYLLALVTFFISEHADFNVSELVDSYFGDNSILQSVASTFVNMPSFIAYESARQSYEEAINNGSSPQLVKQLKRAMNIAKAELDHESSVQRKLNRMAEQAAAQMYKEARAVNKKSKVISSLHTLLFGMLRKLDMSSVDNILSLARDGVVPLSIIPAACATKLTIVVSDFESFKRIFQLGNVQYAGVVWSLTEVKDNDGKPVHIKEITANNTALTWPLVLNCERIVKLQNNEVIPGKLKVRPLKGEGEGDFTADGKALFNNEGGKTFMYAFIADKPDLKVVKWEFDGGCNVIELEPPCRFAVVDAGGNNVVKYLYFVKNLNTLRRGAVLGFIGATVRLQAGKQTELVVNSSLLTLCSFAVDPAKCYLDAVKSGVKPVNNCVKMLSNGSGTGQAVTVGVEANTNQDSYGGASVCLYCRAHVDHPSIDGFCQFKGRYVQIPVGTVDPIRFCLENQVCKVCHCWLNNGCSCDRTSVIQSVDQAYLNRARGSSAARLEPCNGTEPEHVVRAFDIYNKEVASIGKFVKVNCVRFKNLDKHDAFFIVKRCTKSVMEHEQSIYDILKYSGALAIHDFFLWKDGRAIYGNICRQDLTKYTMMDLVNALRNFDEKNCEVLKEILILTGACDSSYFDNKSWYDPVENEDIHRVYAKLGDVIANAMLKCVALCDAMTEKGIVGVITLDNQDLNGNFYDFGDFVTSIPGVGVPVCTSYYSYMMPAMGMTNCLARECFIKSDIFGSDFKTFDLLEYDFTEHKLKLFDKYFKYWGQDYHPDCADCYDEMCIVHCANFNTLFATTIPNTAFGPLCRKVFIDGVPVVTTAGYHFKQLGLVWNKDINTHSTKLSINELLRFVSDPALLVASSPALVDQRTVCFSVAALGTGVTKQTLKPGHFNKEFYDFLREHGFFDEGSELTLKHFFFAQKGDAAIRDFDFYRYNRPTVLDICQARVAYHVVKKYFEIYEGGCIAARDVVVTNLNKSAGYPLNKFGKAGLYYEALSYEEQDALYAVTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQFHQKHLKSIVNTRNATVVIGTTKFYGGWDNMLRNLIDGVDNACLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHENCCTNSDRYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYLKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQAVSANINRILGVNSNTCNNLTVKELQRSLYDNCYRTSTVDPAFVDTFYGYLRKHF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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR036333
NSP10_sf
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR009466 NSP11
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
IPR036499 NSP9_sf
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014827 Viral_protease
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR042515 Nsp15_N
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR014829 NSP8
IPR037227 EndoU-like
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1122 Identity=58.21%
Cov(Q)=13.36% Cov(P)=96.96%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0008168 F:methyltransferase activity
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GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6933
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
389.591929999991
Exp number, first 60 AAs:
0.00314
Total prob of N-in:
0.00180
outside
1 - 2120
TMhelix
2121 - 2140
inside
2141 - 2183
TMhelix
2184 - 2206
outside
2207 - 2268
TMhelix
2269 - 2291
inside
2292 - 2679
TMhelix
2680 - 2702
outside
2703 - 2933
TMhelix
2934 - 2956
inside
2957 - 2962
TMhelix
2963 - 2985
outside
2986 - 2988
TMhelix
2989 - 3011
inside
3012 - 3017
TMhelix
3018 - 3040
outside
3041 - 3345
TMhelix
3346 - 3368
inside
3369 - 3455
TMhelix
3456 - 3478
outside
3479 - 3487
TMhelix
3488 - 3507
inside
3508 - 3513
TMhelix
3514 - 3536
outside
3537 - 3550
TMhelix
3551 - 3573
inside
3574 - 3585
TMhelix
3586 - 3608
outside
3609 - 3617
TMhelix
3618 - 3635
inside
3636 - 3647
TMhelix
3648 - 3670
outside
3671 - 6933
