Strain
Avian_MN794188
(Region: China; Strain: Avian coronavirus; Date: 2019)
Gene
ORF1ab
Description
Annotated in NCBI,
ORF1ab
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGCTTCAAGCCTAAAACAGGGAGCATCTTCCCAAAACCAGAGGAGTGTCATTCTTGTTGCCAAAGACATTCCCGACCACCTTTGTGACGCTTTGTTCTTCTATACGTCACACAACCCAAAAGATTACGCTGATGCTTTCGCCTTTAGGCAGAAGTTCGACCGTAATCTCGGTGCTGGGAAGCAGTTTAAATTTGAAACTGTGTGTGGCCCATTCTTCTTAAAAGGAGTGGACAAAATAACACCAGGTGTCCCAGCCAAAGCTTTAAAGGCCACTTCTAAGTTGGCTGATTTAGAAGACATCTTCGGTGTCTCTCCTTTTGCACGGAAATACCGTGAATTGTTGAAGACAGCATGCCATTGGTCTATGACTGTAGAAACACTGGATGCTTGTGCACAAACTCTTGAAGAAATCTTTGATCCAACTGAGATACTTTGGCTCCAGGTTGCTGCAAAGATTCAAGTTTCAGCCATGGCAATGCGCAGATTTGTTGGTGAGGTTACTGCAAAAGTCATGGATTCACTTGGCTCAAGTTTGAGCGCTCTATTCCAAGTTGTTAAGGAAACAATGGCCAGAATCTTTCAAAAGGCTCTGGCCATTTTTGAGAGTGTGAGTGAATTGCCACAGCGTATTGCTGCGCTTAAGATGGCTTTTGCCAAGTGTGCAAGATCAATTACAATTGTGGTTGTTGGACATGCCCTCACTATTAGAGAGTTTGCTGGAACTTGTCTTGCAAGCATTAATGGTGCAGTTGCAAAATTCTTTGAAGAACTTCCAACTGGCTTTATGGGCGCTAAAGTCTTTTCAACTCTTGCCTTCTTTAAAGAAGCAGCAGTAAAGATTGTAGAAAATATACCAAACGCGCCAAGAGGTACTAAAGGTTTTGAAGTCGTTGGCAATGCTAAAGGTACACAAGTTGTTGTCCGTGGCATGCGAAATGACTTAACTTTGCTTGACCAAAAAGCTGAAGTTCCTGTGGAACCAGAAGGTTGGTCTGCAATCTTGGAGGGACATCTTTGCTATGTCTTTAAGAGTGGTGATCGCTTCTATGCGGCACCTCTTTCAGGAAATTTTGCATTGCATGATGTGCATTGCTGCGAGCGTGTAGTCTGTCTGTCTGATGGTGTAACACCGGAGATAAATGATGGGCTTGTTCTTGCTGCAATCTACTCATCTTTTAGTGTTTCGGAACTTGTGGCAGCACTTAAAAAAGGTGAACCATTCAAGTTTTTGGGGCACAAATTTGTCTATGCGAAGGAAGCGGCAGTTTCTTTCACCTTGGCAAAAGCAGCAACCATTGGAGATGTCCTGAAGTTGTTTCAATCAGCAAGAGTAAAGACGAAAGATGTGTGGTCTGCACTTACTGAACAGTCTTTCGAATTCTGGAAAGTTGCGTACAATAGAGTGCGCAATCTTGAAGAAGTTCTGAAGACTCATTTTTGTAAAGCTCAAATGTCAATTGTGATCCTAGCAGCAGTGCTTGGTGAGGGCATTTGGCATCTCTGTTCGCAAGTCATTTATAAATTGAGTGGCCTGTTTTCTAAAGTCGTTGACTTTTGTGAAAAACACTGGAAAGGTTTCTGTACGCAGTTGCGAAAAGTTAGGCTTGTTGTTACAGAAAACTTTTGTGTGTTGAAAGGAATTGCTCAGCATTGTTTTCAACTTTTGCTGGAAGCACTACACTTTATGTACAAGAGTTTTAAGAAATGTGCACTTGGTAGACTTTCTGGGGATTTATTTTTCTGGAAAGGCGGTGTGCATAAAATTGTGCAGGATGGCGATGAAATTTGGTTTGACGCCATCGATACGATTGAAATTGTAGATCTGGGTATTGTCCAAGAAAAACCTATAGATTTTGAGGTTTGTGAAGACGTAACACTTCCAGAAAATCAACCTGGTCATATGGTTCAAATCGAGGATGACGGAAAGAACTATATGTTCTTCCGCTTCAAAAGGGATGAGAACATCTACTATACACCAATGTCTCAACTTGGTGCAATTAATGTAGTTTGCAAAGCAGGCGGTAAAACCGTTACCTTTGGAGACACCATTGTGAAAGAAATACCGCCACCTGATGTTGTGCCTATTAAGGTTAGCATAGAGTGTTGTGGTGAACCATGGAATACAATCTTCAAGAAAGCTTATAAAGAGCCCATTGAAGTTGAAACTGACCTCACAGTAGAACAATTGCTCTCTGTGATCTATGAGAAAATGTGCGACGACCTCAAATTGTTTCCAGAGGCACCAGAGCCACCGCCATTTGAGAATGTCGCACTTGTTGATAAAAACGGTAAAGACTTGGATTGCATAAAATCATGCCATCTTATCTACCGTGATTATGAGAGTGATGATGACATCGAGGAAGAAGATGCTGAGGAGTGTGATACTGATTTAGAATGTGAAGAAGAGGATGAGGATACTAAAGTGTTGGCTCTTATACAAGACCCTGCAAGTAATAAATACCCTCTTCCTCTTGATGATGATTATAGCGTCTTTAATGGATGTATTGTACATAAGGACGCTCTTGACGTCGTAAATCTACCATCTGGTGAAGAAACCTTTGTTGTCAACAACTGCTTTGAGGGAGCTGTAAAACCACTGCCTCAGAAAGTTGTTGATGTTCTAGGTGACTGGGGTGAGGCTGTTGATGCGCAAGAGCAAATTGCACAAACTACTTCAGAGGAAACCCCTATCAGTAGTTTGGAGGCAACTATTGAGCAAGTTGTTGTTGAGGAACAGAAAATAATTTCTGTTGTTGAAGAAGAACAGCAGGTGGCGGTCTACACACCTGCAGACCTACAAGTTGTTGAAGAAACACTAGATGAGTTTATTCTTATTGCTGATGTTTCCACAGAAGAAATTGTGCCTCATGAAGAGAAGGAGTCACAGATTGAACAGGAGCCTATTCAAGTTGTTAAATCACAACGTGAAAAGAAGGCTAAAAAGTTCAAGGTTAAATCTACTACATGTGAGAAACCCAAATTTTTGGAGTACACAACATGTGTGGGTGACCTAACGGTAGTGATTGCCAAAGCATTGGATGAGTTTAAAGAGTTCTGCATTGTAAATGCTGCTAATGAGCATATGTCTCACGGTGGCGGCGTTGCTAAGGCAATTGCGGACTTTTGTGGACCTGATTTTGTGGAGTATTGTGAGGACTATGTTAAGAAACATGGGCCTCAACAAAGACTTGTCACACCTTCATTTGTCAAAGGCATTCAATGTGTGAACAATGTTGTAGGACCTCGCCATGGAGACAGTAACTTGCATGATAAGCTTGTTGCTGCTTACAAGAATGTTCTTGTAGATGGTGTTGTCAATTATGTTGTGCCAGTCCTCTCATCAGGAATTTTTGGTGTTGATTTTAAGATGTCTATAGACGCTATGCGCAAGGCTTTTGAAGGTTGCGACATACGCGTTCTTCTTTTCTCCTTGTCTCAAGAACACATCGATTATTTCGATGTTACTTGTAAACAGAAGACAATTTATCTTACAGAGGACGGTGTTAAATACCGCTCTGCTACTGTGAAACCAGGTGACTCTTTGAGTCAATTTGGACCGGTTTTTGCTAGAAACAAGACAGTCTTTACAGCAGACGATGTTGAGGACAAAGAAATTCTCTTCATTCCTACTACTGACAAGACTGTCCTCGAATATTATGGTTTGGATGCGCAAAAGTATGTAATATACTTGCAAACTCTTGCACAGAAGTGGAATGTCCAATATAGGGACAATTTTGTTATACTTGAGTGGCGTGATGGAAATTGCTGGATTAATGCAGCAGTAGTGCTCCTTCAAGCTGCTAAGATTAGGTTTAAAGGTTTTCTTGCAGAAGCATGGGCACAACTTTTGGGTGGAGACCCAACTGATTTTGTAGCCTGGTGCTATGCAAGTTGCAATGCTAATGTTGGTGAGTTTTCAGATGCTAATTGGCTTCTTGCTAATTTGGCAGAATACTTTGATGCTGATTACACGAATGCATTCCTTAAGAGGCGTGTGTCATGTAACTGTGGGGTTAAGAATTGTGAAGTTAGAGGCCTTGAAGCTTGTATTCAACCAGTAAAGGCACCCAATCTTCTTCATTTTAAGACTCAGTACACAAATTGTACAGTGTGTGATGCAAATAGTGTGGATGAGGTGGTAGAAGCCTCACTACCATATCTGTTGCTCCTTGCTACTGATGGTCCTACTACAGTGGATTGTGATGAAAATGCTGTAGGGAATGTTGTTTTCATTGGCTCTACTAACAGTGGCCATTGTTATACACAAGCCATTGGTAAGGCTTTTGACAATCTTGCTAAAGATAGAAAATTTGGAAAGAAGTCTCCTTACATTACTGCAATGTATACACACTTCTCTCTTAAGGGTGAAAATCCTTTACCTGTTGTTAAACAGAGTAAAGGAAAAACTAAAGTTGTAAAAGAGGATGTTTCTAATCTTGCCACTAGTTCTAAAGTCAGTTTTGATAATCTTACTGATTTTGAACAGTGGTATGATAGTAACATCTACGAGTGTCTTAGAGTACAGGAAATGCCTGATAATTTTGATGAATATGTGTCATTTACAACAAAGGAAGATTCTAAGTTGCCATTGACGCTTAAAGTTAGAGGTATTAGATCAGTTGTTGATTTTAAATCAAAGGATGGTTTTACTTACAAGTTAACACCTGATACTGATGAAAATTCAAAGGCACCAGTATACTACCCTGTCTTAGATGCTATTAGTCTTAAGGCAATATGGGTTGAAGGTACTGCAAATTTTCTTGTTGGTCATCCAAACTACTATAGTAAATCTCTTCGCGTTCCCACTTTTTGGGAAAATGCAGAGAGCTTTGTTAAAATAGGAGAAAAAGTTGATGGTGTGACTACTGGTCTTTGGCGTGCAGAACACCTTAATAAACCTAACTTGGAGAGAATTTTCAACATTGCTAAGAAAGCAATTGTTGGGACCAGTGTTGTTACTACACAATGTGGTAAATTACTTAGTAAAGCAGCTACATT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Protein
MASSLKQGASSQNQRSVILVAKDIPDHLCDALFFYTSHNPKDYADAFAFRQKFDRNLGAGKQFKFETVCGPFFLKGVDKITPGVPAKALKATSKLADLEDIFGVSPFARKYRELLKTACHWSMTVETLDACAQTLEEIFDPTEILWLQVAAKIQVSAMAMRRFVGEVTAKVMDSLGSSLSALFQVVKETMARIFQKALAIFESVSELPQRIAALKMAFAKCARSITIVVVGHALTIREFAGTCLASINGAVAKFFEELPTGFMGAKVFSTLAFFKEAAVKIVENIPNAPRGTKGFEVVGNAKGTQVVVRGMRNDLTLLDQKAEVPVEPEGWSAILEGHLCYVFKSGDRFYAAPLSGNFALHDVHCCERVVCLSDGVTPEINDGLVLAAIYSSFSVSELVAALKKGEPFKFLGHKFVYAKEAAVSFTLAKAATIGDVLKLFQSARVKTKDVWSALTEQSFEFWKVAYNRVRNLEEVLKTHFCKAQMSIVILAAVLGEGIWHLCSQVIYKLSGLFSKVVDFCEKHWKGFCTQLRKVRLVVTENFCVLKGIAQHCFQLLLEALHFMYKSFKKCALGRLSGDLFFWKGGVHKIVQDGDEIWFDAIDTIEIVDLGIVQEKPIDFEVCEDVTLPENQPGHMVQIEDDGKNYMFFRFKRDENIYYTPMSQLGAINVVCKAGGKTVTFGDTIVKEIPPPDVVPIKVSIECCGEPWNTIFKKAYKEPIEVETDLTVEQLLSVIYEKMCDDLKLFPEAPEPPPFENVALVDKNGKDLDCIKSCHLIYRDYESDDDIEEEDAEECDTDLECEEEDEDTKVLALIQDPASNKYPLPLDDDYSVFNGCIVHKDALDVVNLPSGEETFVVNNCFEGAVKPLPQKVVDVLGDWGEAVDAQEQIAQTTSEETPISSLEATIEQVVVEEQKIISVVEEEQQVAVYTPADLQVVEETLDEFILIADVSTEEIVPHEEKESQIEQEPIQVVKSQREKKAKKFKVKSTTCEKPKFLEYTTCVGDLTVVIAKALDEFKEFCIVNAANEHMSHGGGVAKAIADFCGPDFVEYCEDYVKKHGPQQRLVTPSFVKGIQCVNNVVGPRHGDSNLHDKLVAAYKNVLVDGVVNYVVPVLSSGIFGVDFKMSIDAMRKAFEGCDIRVLLFSLSQEHIDYFDVTCKQKTIYLTEDGVKYRSATVKPGDSLSQFGPVFARNKTVFTADDVEDKEILFIPTTDKTVLEYYGLDAQKYVIYLQTLAQKWNVQYRDNFVILEWRDGNCWINAAVVLLQAAKIRFKGFLAEAWAQLLGGDPTDFVAWCYASCNANVGEFSDANWLLANLAEYFDADYTNAFLKRRVSCNCGVKNCEVRGLEACIQPVKAPNLLHFKTQYTNCTVCDANSVDEVVEASLPYLLLLATDGPTTVDCDENAVGNVVFIGSTNSGHCYTQAIGKAFDNLAKDRKFGKKSPYITAMYTHFSLKGENPLPVVKQSKGKTKVVKEDVSNLATSSKVSFDNLTDFEQWYDSNIYECLRVQEMPDNFDEYVSFTTKEDSKLPLTLKVRGIRSVVDFKSKDGFTYKLTPDTDENSKAPVYYPVLDAISLKAIWVEGTANFLVGHPNYYSKSLRVPTFWENAESFVKIGEKVDGVTTGLWRAEHLNKPNLERIFNIAKKAIVGTSVVTTQCGKLLSKAATFIADKLGGGVVRNITDRVKGLCGFTRGHFERKLSPQFIKTLIFFFFYFVKASAKSVATSYKRVLCKVVFTTLFILWFMYTSKPVIFTGIRILDFLFEGSVCGPYNDYGKDTFDVLRYCEDDFTCRVCLHDRDSLHLYKHAYSVEQFYKSAVSGINWNWLYLVFLILFVKPVAGFVIICYCVKYLVLSSTVLQTGVGFLDWFVQTVFTHFNFMGAGFYFWLFYKIYIQVHHILYCKDITCEVCKKVVRSNRQEVSVVVGGRKQIVHVYTNSGYNFCKRHNWYCRNCDEYGHQNTFMSPEVAGELSDKLKRHVKPTAYAYHVVDDACVVDGFVNLKYKAAIPGKDSASPAVKCFSVTDFLKKAVFLKEALKCEQISNDSFIVCNTQSAHALEEAKNAAIYYAQCLCKPILILDQALYEQLVVEPVSKCVVDKVCSILSNIISVDTAALNYKAGTLRDCLLSVTKDEEAVDMAIFCHNHDVEYTTDGFTNVIPSYGVDTDRLTPRDRGFLINADASVANLRVKNSPPVVWKFSDLIKLSDSCLKYLISATVKSGGRFFITKSGAKQVFSCHTQKLLVEKKAGGVTSDTFKWLKSCFKWLFIFYILFTACCLSYYYVEMNRSFVHPMYDVNSTLHVEGFKVIDKGVIREIVSEDTCFSNKYVNFDAFWGKPYENNRNCPIVTAVIDGDGTVAAGVPGFVSWVLDGAMFVHMTQTERKPWYIPTWFNREIVGYTQDSIITEGSFYTSIALFSARCLYLTASNTPQLYCFNGDNDAPGALSFGSIIPHRVYFQPNGVRLIVPQQIFHTPYIVKFVSDSYCRGSVCEYTKPGYCVSLNSQWVLFNDEYTSKPGVFCGSTVRELMFNMVSTFFTGVNPNIYMQLAIMFLILVVVVLIFAMVIKFQGVFKAYATVVFTIMLVWVINAFVLCVHSYNSVLAVVLLVLYCYASLVTSRNTSIIMHCWLVFTFGLIVPTWLACVYLGFILYMYTPLFFWCYGTTKNTRKLYDGNEFVGSYDLAAKSTFVIRGPEFVKLTNEIGDKFEHYLSAYARLKYYSGTGSEQDYLQACRAWLAYALDQFRSSGVEVVYTPPRYSIGVGRLQAGFKKLVSPSSAVEKCIVSVSYRGNNLNGLWLGDSIYCPRHVLGKFSGDQWGDVLNLANNHEFEVVTGNGVTLSVVSRRLKGAVLILQTAIVNADTPKYKFLKANCGDSFTIACSYGGIVIGLYPVTMRSNGTIRASFLAGACGSVGFNIEKGVVNFYYMHHLELPNALHTGTDLMGEFYGGYIDEEVAQKVQPDKLVTNNILAWLYAAIISVRESSFSTPKWLESTTVSIEDYNKWAVDNGFTSFVSCTAITKLSAITGVDVCKLLRTIMVKSTQWGSDPILGQYNFEDEMTPESVFNQVGGVRLQSSVVKKAASWFWSRCVLACFLFVLCSIVLFTAIPYRYYLHGAVVLFATVLFVSFTVKHVMAYMDTFLLPTLITVIIGVCAEVPFIYNTLISQIVIFFSQWYDPVVLDTVVPWMFLPLVLYTAFKCIQGCYSVNSFNTSLLVLYQFMKLGFVIYTSSNTLTAYSEGNWELFFELVHITVLANVSSNSLIGLIVFKFAKWMLYYCNASYLNNYVLMAVIINGIGWMFTCYFGFYWWINKVFGLTLGKYSFKVSVDQYRYMCLHKINPPKTVWEVFSTNILIQGIGGDRVLPIATVQSKLSDVKCTTVVLMQLLTKLNVEANSKMHAYLVELHNKILASDDVNECMDNLLGMLVTLFCVDSTIDLSEYCDDILKRSTVLQSVTQEFSHIPSYAEYERAKDLYEKVLADSKNGSVTQQELAAYRKAANIAKSVFDRDLAVQKKLDSMAERAMTTMYKEARVTDRRAKLVSSLHALLFSMLKKIDSEKLNVLFDQASSGVVPLATVPIVCSNKLTLVVPDPETWVKCVEGMHVTYSTVVWNIDNVIDADGTELQPISTGDGLAYCISGGNIAWPLKVNLTRNVHNKVDAVLQNNELMPHGVKIKACVAGVDQAHCSVESKCYYTNISGNSVVAAITSSNPNLKVASFLNEAGNQIYVDLDPPCKFGMKVGDKVEVVYLYFIKNTRSIVRGMVLGAISNVVVLQSKGYETEEVDAVGILSLCSFAVDPADTYIKYVAAGNQPLGNCVKMLTVHNGSGFAITSKPSPTPDQDSYGGASVCLYCRAHIAHPGGAGNLDGRCQFKGSFVQIPTTEKDPVGFCLRNKVCTVCQCWIGHGCQCDSLRQPKPLVQSDVGAPGFDKNYLNRVRGSSEARLIPLANGCEPDVVERAFDVCNKESAGMFKNLKRNCARFQEVCGTEDGNLEYYDSYFVVKQTTPSNYEHEKSCYEDLKSEVTADHDFFVFNKNIYNISRQRLTKYTMMDFCYALRHFDPKDCEVLKEILVTYGCIEDYHPKWFEENKDWYDPIENPKYYAILAKMGLIVRRALLNAVEFGNLMVEKGYVGVVTLDNQDLNGKFYDFGDFQKTAPGAGVPVFDTYYSYMMPIIAMTDALAPERYFEYDVHKGYKSYDLLKYDYTEEKQELFQKYFKYWDQEYHPNCRDCVDDRCLIHCANFNVLFSTLIPQTSFGNLCRKVFVDGVPFIATCGYHSKELGVIMNQDNTMSFSKMGLSQLMKFVGDPALLVGTSNNLVDLRTSCFSVCALSSGITHQTVKPGHFNKDFYDFAEKAGMFKEGSSIPLKHFFYPQTGNAAINDYDYYRYNRPTMFDIRQLLFCLEVTSKYFECYEGGCIPASQVVVTNLDKSAGFPFNKFGKARLYYEMSLEEQDQVFESTKKNVLPTITQMNLKYAISAKNRARTVAGVSILSTMTNRQFHQKVLKSIVNTRNAPVVIGTTKFYGGWDNMLRNLVKGVEDPMLMGWDYPKCDRAMPNLLRIAASLVLARKHTNCCTWSERIYRLYNECAQVLSETVLATGGIYVKPGGTSSGDATTAYANSVFNIIQATSANVARLLSVITRDIVYDDIKSLQYELYQQVYRRVNFDPAFVEKFYSYMCKNFSLMILSDDGVVCYNNTLAKQGLVADISGFREILYYQNNVYMADSKCWVEPDLEKGPHEFCSQHTMLVEVDGEPRYLPYPDPSRILGACVFVDEVDKTEPVAVMERYIALAIDAYPLVHHENEEYKKVFFVLLSYIRKLYQELSQSMLIDYSFVMDIDKGSKFWEQEFYENMYRAPTTLQSCGVCVVCNSQTILRCGNCIRKPFLCCKCCYDHVMHTDHKNVLSINPYICSQPGCGEADVTKLYLGGMSYFCGNHKPKLSIPLVSNGTVFGIYRANCVGSENVDDFNQLATTNWSTVEPYILANRCSDSLRRFAAETVKATEELHKQQFAS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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR009003
Peptidase_S1_PA
IPR014822 NSP9
IPR037227 EndoU-like
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR040795 Nsp1a_N
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
IPR036333 NSP10_sf
IPR014829 NSP8
IPR042515 Nsp15_N
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR014827 Viral_protease
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR036499 NSP9_sf
IPR009466 NSP11
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6M71
E-value=0.0 Score=1184 Identity=61.97%
Cov(Q)=14.16% Cov(P)=99.36%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
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Subcellular Location
From MSLVP
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6610
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
401.980279999997
Exp number, first 60 AAs:
0.00019
Total prob of N-in:
0.00340
outside
1 - 1732
TMhelix
1733 - 1755
inside
1756 - 1823
TMhelix
1824 - 1846
outside
1847 - 1865
TMhelix
1866 - 1888
inside
1889 - 2256
TMhelix
2257 - 2279
outside
2280 - 2537
TMhelix
2538 - 2560
inside
2561 - 2564
TMhelix
2565 - 2587
outside
2588 - 2590
TMhelix
2591 - 2610
inside
2611 - 2622
TMhelix
2623 - 2645
outside
2646 - 2867
TMhelix
2868 - 2885
inside
2886 - 3075
TMhelix
3076 - 3098
outside
3099 - 3102
TMhelix
3103 - 3120
inside
3121 - 3132
TMhelix
3133 - 3155
outside
3156 - 3169
TMhelix
3170 - 3192
inside
3193 - 3204
TMhelix
3205 - 3227
outside
3228 - 3236
TMhelix
3237 - 3259
inside
3260 - 3278
TMhelix
3279 - 3301
outside
3302 - 6610
